1、学历类型不同：函授本科也就是成人教育本科，函授只是成人教育的一种学习形式；而网络教育本科也叫远程教育本科，是网上学习的一种学历形式。
2、适合人群不同：函授本科主要的人群是工作比较忙，不急于取得毕业证书，但想轻松获证的人员；而网络教育本科适合人群主要是路途远，工作忙,没时间，不方便到学校上课，上网比较方便，学习自觉性比较高的人员。
3、学习形式不同：函授本科教学主要以有计划、有组织、有指导的自学为主，并组织系统的集中面授，函授教学的主要环节有：辅导答疑、作业、试验、实习、考试、课程设计、毕业设计及答辩，每学年安排3次左右为期10天或半个月的集中面授。面向教师招生的院校，面授时间一般为寒暑假；而网络教育本科采取在线和离线学习相结合的现代化教学方式，通过网络学习平台进行在线自主学习、网上答疑辅导、网上作业教学活动，利用网络教学资源平台进行非实时课件点播和运用现代网络技术手段实现协作、互助学习，辅之必要的集中面授，全方位支持学生的自主学习。
4、入学考试形式不同：函授本科要参加全国统一组织的成人高考，主要是各省教育考试院安排考试，属于国考；而网络教育入学考试是由各招生院校组织命题和考试，属于校考。
5、毕业证书不同：函授本科属于成人教育文凭，毕业证书属于是成人高等教育；而网络教育本科毕业证书是普通高等学校会注明网络教育形式。